Nova-111 сочетает в себе пошаговать и реалтайм. Перемещение происходит по ходам. Враждебные существа двигаются вместе с кораблем. А вот окружающие объекты меняют позиции в реальном времени. К примеру, те же сталактиты при падении не будут ждать, пока звездолет походит по клеткам.
В игре 3 мира. Каждый состоит из 6 уровней. Сами они разделены на три зоны. В конце последнего этапа пользователя ждет битва с боссом. Контрольных точек тут нет. Чтобы атаковать соперника, нужно просто передвинуть свой транспорт на его клетку. С получением лазерного луча врагов можно уничтожать на расстоянии, а также нажимать на кнопки.
По мере прохождения судно научится перемещаться через один квадрат и оглушать противников бомбами. В Nova-111 использование способностей тратит заряды науки. Эту шкалу и полоску здоровья можно увеличить, если искать апгрейды в секретных местах. Для открытия самих скиллов нужно собирать на локациях пропавших научных сотрудников.
В игре 5 типов недругов. Остальные встречающиеся супостаты являются их вариациями. Из-за реалтаймогового окружения схватки порой нужно успеть закончить как можно быстрее. Сражения разбавляются решением пазлов. Сюжет посвящен путешествию группы ученых через чужие планеты. Они ищут своих коллег и хотят починить пространственно-временной континуум. История подается в шуточном стиле. Тут много юмора.