В Autopsy Simulator игрок погрузится в больницу, полную тайн и атмосферы хоррора. Пользователь побывает в роли патологоанатома Джека. К нему попадает погибшая женщина, а во время вскрытия он обнаруживает внутри нее обручальное кольцо своей давно пропавшей жены Кейт. События продолжаются и случаются новые элементы, постепенно открывающиеся глаза подопечного.
Главному герою предстоит сражаться с темными силами и собственным разумом, перемещаясь по ужасающей больнице, изменившей облик. Просматривая файлы и изучая отчеты, он узнает историю жизни жертвы. Чтобы узнать каждую частичку информации, понадобится проводить вскрытие и извлекать внутренние органы погибшей. У каждого тела имеется своя история, которую нужно раскрыть, изучая записи и проводя вскрытие.
Разработчики уделили особое внимание реалистичности. Каждый орган детально перенесен в проект, а картирование происходит правдоподобным образом. Травмы, счета и другие случаи сделаны с вниманием к мелким деталям. Процесс комбинирует реалистичную картину вскрытия и леденящую кровь интересную историю. Каждое дело было создано благодаря судебно-медицинским экспертам и при помощи патоморфологов, что заставит геймер вовлечься в геймплей. Понадобится пользоваться медицинскими инструментами и исследовать здание, доставая нужные файлы.