Fe – это трёхмерный платформер с элементами метроидвании и стелса. В игре открытый мир. Он представляет собой лес с налётом мрачных оттенков. Главная особенность проекта заключается во взаимодействии героя с окружением при помощи музыки. Сюжетная завязка в Fe отсутствует, а история подается визуально, без текста. Протагониста зовут Фе. Он похож на гибрид лисёнка и волчонка. Герой попадает в тёмную чащу, которую пытаются захватить роботы. Они сковывают местных обитателей и крадут у них детенышей.
Персонаж проскальзывает мимо врагов, освобождает зверей, возвращает детей родителям и выучивает новые языки. Полученные знания помогают протагонисту добираться в ранее недоступные места. Если правильно спеть, то флора и фауна окажет этому необычному существу помощь. Олень разрешить прокатиться на себе, и будет раскидывать врагов, орел позволит летать, цветы подбросят вверх или дадут возможность парить, грибы отодвинутся и пропустят вперед. Этот процесс реализован в виде мини-игры, где нужно подбирать звуки так, чтобы получилась нужная мелодия. В проекте присутствует разнообразие декораций. Кроме лесных локаций встречаются болота, пустыни и заснеженные участки. Сохранять прогресс разрешают только на чекпоинтах. В свое своей гибели персонаж возрождается на них. Сам зверек очень слаб и хил. Самостоятельно он ничего не может противопоставить недругам. А вот противники охотно нападают на него. Из-за этого приходится красться и прятаться от враждебных безмолвных созданий В игре есть карта, на которой отмечено, куда надо идти.