Crystalline переносит геймеров в мир под названием Терра вместе с главным героем. Протагонист оказывается в незнакомом для себя измерении и вскоре знакомится с Леанной. Девушка, что является магом и рыцарем, пришла проверить слухи о сосредоточении энергии в месте появления незнакомца. Очень быстро выясняется, что источником энергетического всплеска оказался сам молодой человек. Волшебница отправляется с ним в путешествие, чтобы выяснить, как он сюда попал. Также она пытается найти способ помочь ему вернуться домой.
Crystalline – это визуальная новелла. Графика в ней напоминает анимешную рисовку. Её геймплей вполне традиционный для жанра: читаем текст в больших объемах и изредка совершаем выбор. Принятые решения в основном влияют на появление или отсутствие некоторых сцен. Порой они оказывают влияние на дальнейшее развитие истории и финал. Сюжет здесь в целом линейный, и от действий пользователя тут зависит только способ его подачи. У игры несколько концовок, причем привычных плохих среди них нет.
Повествование сочетает в себе комедию, романтику и фэнтези. Тайтл изобилует шуточными отсылками к современной поп-культуре. Основной упор здесь делается на взаимодействии героя с остальными персонажами. Здесь спрайты неписей анимированы во время диалогов. Вдобавок все NPC озвучены.