Magical Diary: Horse Hall является визуальной новеллой с элементами симулятора свиданий и ролевой игры. Проект использует двухмерную рисованную графику, выполненную в анимешной стилистике. Ещё тут присутствует редактор персонажей. С самого начала здесь позволяют создать собственную героиню. Сменить пол нельзя, но можно выбрать прическу, подобрать цвет волос, кожи и глаз, а также придумать имя. Помимо этого есть кастомизация, но она становится доступной уже во время прохождения. На заработанные деньги можно покупать косметические предметы: очки, новый скин для волшебной палочки, крылья и т. п.
По сюжету девушка-протагонист поступает в магическую академию. История посвящена студенческим будням и повседневности. Молодая женщина учится, знакомится с людьми и иногда попадает в передряги. Тайтл во многом рассчитан на женскую аудиторию. В Magical Diary: Horse Hall позволяют дружить или заводить романтические отношения с парнями и девушками. Однако делать это необязательно.
В игре есть смена дней. Каждую неделю тут надо планировать расписание наперед. Необходимо выбирать, какие дисциплины будет постигать девушка. В ходе обучения у неё прокачиваются соответствующие навыки. Для изучения доступно 70 заклинаний. Периодически нужно сдавать экзамены. В такие моменты героиню забрасывают в одно из подземелий и предлагают ей найти выход. Для достижения цели надо решать загадки с помощью магии. У пазлов есть несколько способов решения. Сам проект весьма нелинейный. В нем часто дают делать выбор, и действия пользователя сильно влияют на повествование. Можно разблокировать дополнительные сюжетные линии и открыть секретные события.