Vietcong 2 – захватывающий шутер от первого лица. В игре представлены две кампании: Вьетнам и США. В кампании США главный герой становится капитаном командирования по оказанию военной помощи вьетнаму, выступающим за армию США, по имени Дуглас Бун. По сюжету, Дуглас сопровождает военного журналиста, который снимает репортаж о том, как в период перемирия проходит празднование традиционного нового года в городе Хюэ.
В задачи протагониста входит командовать морпехами, прокладывая путь к победе с минимальными потерями, грамотно выстраивать тактику ведения боя, продумывая все до мелочей. Фракция Вьетнама, напротив, имеет характер сюжета, более направленный на военные действия. Повествование идет от лица новоиспеченного молодого солдата армии Северного Вьетнама. Он отважно сражается с противниками со стороны Южного Вьетнама, окруженный живописными пейзажами рисовых полей, бескрайних джунглей и деревень, залитых светом заходящего солнца. По течению сюжета солдат получает звание сержанта и принимает участие в нападении на Императорский дворец в Хюэ. Играя за кампанию Вьетнама, игроку предстоит выполнить множество небольших заданий: подбросить взрывчатку, разграбить конвой, напасть из засады. Кроме того, за главным героем на протяжение всей игры будут следовать надежные напарники, один из которых – медик, а второй - старший напарник с боеприпасами.